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2018—2019年我国北方地区奶牛临床型乳房炎源肺炎克雷伯菌的分子特征 Article
宋士凯, 何文娟, 杨大伟, Manar Benmouffok, 王瑶, 李基云, 孙城涛, 宋祥彬, 马士珍, 蔡畅, 丁双阳, 吴聪明, 沈张奇, 汪洋
《工程（英文）》 2022年 第10卷 第3期 页码 146-154 doi: 10.1016/j.eng.2021.01.015
肺炎克雷伯菌是奶牛乳房炎的重要诱因，常引起奶牛的产奶量降低和死亡率增高。目前尚缺乏奶牛乳房炎源肺炎克雷伯菌分子特征的研究数据，限制了对其在食品生产链中传播风险的评估。本研究于2018—2019 年从我国北方地区患临床型乳房炎奶牛中采集了6301 份奶样，共分离到183 株肺炎克雷伯菌，两年的平均分离率分别为3.03%和2.80%。与人类临床肺炎克雷伯菌分离株相似，奶牛临床型乳房炎源肺炎克雷伯菌分离株可分为肺炎克雷伯菌(KpI，143 株）、准肺炎克雷伯菌（KpII-B，37 株）和变栖肺炎克雷伯菌（KpIII，3 株）三个种群。
肠道优势菌群丰度变化与COVID-19严重程度相关性的临床意义 Article
汤灵玲,顾思岚,龚忆雯,李博,鲁海峰,李强,张如洪,高翔,吴正洁,张佳颖,张园园,李兰娟
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第10期 页码 1178-1184 doi: 10.1016/j.eng.2020.05.013
新冠病毒肺炎（COVID-19）是一种高度传染性疾病。与H7N9感染相似，COVID-19的典型临床表现是肺炎和细胞因子风暴。本研究的目的是利用定量聚合酶链反应（q-PCR），研究COVID-19患者的10种主要肠道优势菌群的丰度变化，从而建立这些菌群与COVID-19临床指标之间的相关性。结果表明，COVID-19患者的10种主要肠道菌群丰度出现变化，这些肠道微生物菌群的变化与疾病严重程度和血液学指标有关。产丁酸菌，如普拉梭菌（Faecalibacterium prausnitzii）、酪酸梭菌（Clostridium butyricum）、柔嫩梭菌（Clostridium这些结果表明，这些肠道优势菌群可作为COVID-19的诊断生物标志物，并且Ec/E值可用于预测危重型患者预后。
鱼类肠道菌群研究进展及潜在应用 Review
栾银银, 黎明, 周伟, 药园园, 杨雅麟, 张震, Einar Ringø, Rolf Erik Olsen, Jihong Liu Clarke, 解绶启, 麦康森, 冉超, 周志刚
《工程（英文）》 2023年 第29卷 第10期 页码 137-146 doi: 10.1016/j.eng.2022.12.011
肠道菌群在宿主健康和疾病中起着重要作用。我们对鱼类菌群的理解远落后于人类和其他哺乳动物。尽管如此，现有研究也强调了微生物对鱼类的健康、生长性能和各种生理功能中的重要性。鱼类菌群的组成取决于宿主选择、饮食和环境等因素。肠道菌群可以影响鱼类宿主的营养代谢、免疫和抗病能力，而宿主则通过免疫和非免疫因素以鱼菌互作的方式调节肠道菌群的稳态。在本篇综述中，我们讨论了鱼类微生物研究的最新进展，描述了包括鱼类微生物多样性，以及宿主-菌群交互作用的研究结果。同时，还讨论了鱼类菌群对鱼类健康及行业可持续发展的潜在作用。
王玉兰, 王保红, 吴俊芳, 江向洋, 唐惠儒, Ole H. Nielsen
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 83-89 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.013
赵浏阳, 张翔, 左涛, 于君
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 90-97 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.012
甘玲玲,王蔚芳,高淳仁,雷霁霖
《中国工程科学》 2014年 第16卷 第9期 页码 21-25
Mitch Leslie
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第10期 页码 1064-1066 doi: 10.1016/j.eng.2020.09.001
应对新冠病毒肺炎疫情的东西方分异 Article
Dean T Jamison, Kin Bing Wu
《工程（英文）》 2021年 第7卷 第7期 页码 936-947 doi: 10.1016/j.eng.2021.05.008
截至2021年5月，西方国家每百万人口中新冠病毒肺炎（简称新冠肺炎）死亡人数往往超过东方国家的100倍。到2020年1月初，中国武汉市发生非典型病毒性肺炎的预警促使东亚诸多司法管辖区迅速做出反应。2020年1月10日，病毒基因组的发布为进行诊断测试和开展疫苗研发提供了重要信息。截至2020年3月下旬，中国新冠肺炎疫情已经得到全面控制，而其他的RCEP成员国也已提早采取了果断措施（包括限制出行），从而避免了严重的结局。在2020年2月这一关键时期，美国和其他一些西方国家的不作为导致新冠肺炎的肆虐和传播。东西方国家都广泛实施了严格的全民非药物干预措施，社会、经济和教育系统都付出了巨大的代价。
深古菌门的核心代谢功能和热环境起源 Article
冯晓远, 王寅炤, Rahul Zubi, 王风平
《工程（英文）》 2019年 第5卷 第3期 页码 498-504 doi: 10.1016/j.eng.2019.01.011
深古菌门具有复杂的亚群分类，是地球上丰度最高的微生物之一。然而，深古菌的代谢特征和演化历史仍然有待进一步研究。本研究对来自10个不同亚群的15个新获得和36个已经发表的深古菌基因组进行了比较基因组分析，揭示了深古菌门的核心代谢特征，即蛋白质、脂质、芳香族化合物降解，糖酵解途径和Wood–Ljungdahl上述核心代谢特征表明深古菌使用乙酰辅酶A作为重要的代谢中间物。此外，部分深古菌亚群还具有不完整的柠檬酸循环、产乙酸途径和硫化物相关的代谢潜能，表明不同亚群具有多样的代谢能力和生态功能。亚群Bathy-21和Bathy-22位于深古菌系统发育树根部，是目前已知最古老的两个深古菌亚群。综上，本研究对深古菌门的核心代谢能力进行了系统性研究和总结，并揭示了深古菌热环境起源的演化历史。
李芬妮 ,张俊飚 ,姚方杰, 傅廷栋
《中国工程科学》 2019年 第21卷 第4期 页码 105-110 doi: 10.15302/J-SSCAE-2019.04.009
新冠病毒肺炎肺部超声的特点及其在病情评估中的价值——一项回顾性观察研究 Article
朱凤雪, 赵秀娟, 王天兵, 王振洲, 郭辅政, 薛海岩, 常盼盼, 梁汉生, 倪文涛, 王雅心, 陈雷, 姜保国
《工程（英文）》 2021年 第7卷 第3期 页码 367-375 doi: 10.1016/j.eng.2020.09.007
肺部超声（lung ultrasound, LUS）在新冠病毒肺炎（简称新冠肺炎）病情严重程度评估中的价值不明确。本研究旨在探讨新冠肺炎的LUS影像学特征，并分析LUS征象与新冠肺炎疾病严重程度的关系。本研究为在同济医院进行的一项回顾性观察研究，连续入选48例新冠肺炎患者，并将其分为32例非危重患者和16例危重患者。通过LUS发现新冠肺炎患者38例。新冠肺炎的LUS征象包括B线（34/38, 89.5%）、实变（6/38,15.8%）和胸腔积液（2/38, 5.3%）。因此，LUS在新冠肺炎患者中能简便、实时、安全地检测肺部病变，LUS有助于在危重患者中评估新冠肺炎的严重程度。
吕桂帅, 程宁涛, 王红阳
《工程（英文）》 2017年 第3卷 第1期 页码 110-114 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.017
特力阿扎维林治疗新冠病毒肺炎的疗效和安全性——试验方案 Protocol
吴效科, 于凯江, 王永晨, 徐万海, 马红丽, 侯艳, 李悦, 蔡本志, 朱丽影, 张敏, 胡晓丽, 高敬书, 王宇, 秦慧超, 赵鸣雁, 张勇, 李康, 杜智敏, 杨宝峰
《工程（英文）》 2020年 第6卷 第10期 页码 1199-1204 doi: 10.1016/j.eng.2020.06.011
根据2019年12月的报道，新冠病毒肺炎（coronavirus disease 2019, COVID-19）是由一种新型冠状病毒引起的肺炎。到目前为止，还没有发现能够治疗这种病毒的有效药物。
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2018—2019年我国北方地区奶牛临床型乳房炎源肺炎克雷伯菌的分子特征
宋士凯, 何文娟, 杨大伟, Manar Benmouffok, 王瑶, 李基云, 孙城涛, 宋祥彬, 马士珍, 蔡畅, 丁双阳, 吴聪明, 沈张奇, 汪洋
期刊论文
鱼类肠道菌群研究进展及潜在应用
栾银银, 黎明, 周伟, 药园园, 杨雅麟, 张震, Einar Ringø, Rolf Erik Olsen, Jihong Liu Clarke, 解绶启, 麦康森, 冉超, 周志刚
期刊论文
京公网安备 11010502051620号
